Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rmdn3Q3UJU9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms