Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edc4Q3UJB9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edc4Q3UJB9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms