Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm648Q3UJ22 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm648Q3UJ22 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms