Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms