Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms