Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms