Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U7U4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U7U4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms