Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U6N9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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