Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm4dQ3U2K5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms