Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2I3

Fam160a2, FTS and Hook-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam160a2Q3U2I3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam160a2Q3U2I3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms