Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc174Q3U155 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms