Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Hbq1bQ3U0A6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Hbq1bQ3U0A6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Hbq1bQ3U0A6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hbq1bQ3U0A6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Hbq1bQ3U0A6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hbq1bQ3U0A6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms