Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQR0

Pgap2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap2Q3TQR0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pgap2Q3TQR0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pgap2Q3TQR0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms