Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms