Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CiartQ3TQ03 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms