Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL09

G430049J08Rik, RIKEN cDNA G430049J08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G430049J08RikQ3TL09 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms