Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4cQ3TKR2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms