Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms