Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms