Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms