Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M3Q31093 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M3Q31093 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms