Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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