Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms