Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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