Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Ttc39dQ0VF76 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ttc39dQ0VF76 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ttc39dQ0VF76 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ttc39dQ0VF76 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc39dQ0VF76 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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