Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prelid2Q0VBB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms