Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps8Q0P5W1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms