Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms