Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms