Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm1Q0GA42 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms