Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms