Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms