Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms