Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
MestQ07646 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MestQ07646 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MestQ07646 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms