Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col17a1Q07563 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col17a1Q07563 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms