Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2Q07279 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2Q07279 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms