Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPINDOCQ05AH6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPINDOCQ05AH6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms