Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms