Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms