Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox13Q04891 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms