Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox12Q04890 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms