Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1Q04750 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms