Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms