Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms