Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms