Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnb1Q02248 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms