Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms