Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms