Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbp1Q01514 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms