Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms